一、动物遗传育种学

主要开展山东省特色畜禽结构基因组学与功能基因组学，优异性状形成的遗传基础，动物遗传资源评价、保护与利用，性能测定与遗传评估等相关研究。

二、动物营养与饲料科学

主要开展特色畜禽营养需要，营养代谢及其调控，营养与畜产品品质，畜禽地源性饲料资源的开发和高效利用等方面的研究。

三、智慧养殖与动物生产学

主要开展畜禽智能养殖数据收集、处理与模型构建；畜禽养殖环境控制及健康生产，畜牧环境微生物工程及畜禽废弃物无害化处理和资源化利用等研究。

四、健康养殖

主要开展动物病原微生物分子流行病学调查、致病机制、噬菌体及中兽医药等研究。