2024年9月2日,由科学技术处主办、农业与生物学院承办的“聊大讲坛”讲座在三号楼二楼虚拟仿真实验室举行。香港城市大学李帅成教授受邀进行了题为《组学数据的层次结构》的精彩学术报告。报告由聊城大学毛驴高效繁育与生态饲养研究院王长法教授主持,农业与生物学院、计算机学院和数学科学学院共40余名教师与研究生参加了报告会。
李帅成教授的报告围绕组学数据的层次结构挖掘和算法进行详细的介绍,并分为细胞的聚类结构、基因组的聚类结构、图的聚类等主题展开。阐述了如何针对海量的基因组测序数据,如何开发各种现代算法发掘这种层次结构,更好地逐级处理和解析这些数据。最后,还报告了如何通过构建可视化工具,使得生物体内各种生物过程的详细信息数据中复杂且独特的层次结构更易于理解和解释。
李帅成教授课题组针对现代基因组学最热门的单细胞测序数据、空间组学数据、宏基因组学、癌症基因组学数据,开发出对应的SEAT、Super TLD、Ambigram、LocalHGT等多种算法和计算工具,可用于挖掘和分析上述组学数据中的层次结构,相关成果相继发表在Nature Communications、NAR等国际权威期刊上。还开发出多组学数据分析网站(deepomics.org),该网站提供了组学分析平台、组学分析可视化、数据资源平台和计算资源平台等多种工具和资源,旨在帮助研究人员深入分析和理解基因组、蛋白质组等复杂生物数据。这些工具不仅提高了数据分析的效率和准确性,还促进了生物信息学领域的发展。
报告会后,李帅成与参会师生进行了热烈交流和讨论。本期“聊大讲坛”的成功举办,开阔了师生们的学术视野,加深了学生们对基因组学海量数据层次结构的理解,为后续双方深化合作奠定了坚实基础。
李帅成教授简介:
李帅成,香港城市大学教授,博导。研究重点是开发算法和计算工具来分析大规模基因组和蛋白质组数据,目的是了解复杂生物过程的潜在机制。在生物信息学方面的显著贡献包括开发用于基因组组装和注释的新算法、分析基因表达数据以识别疾病相关基因,以及开发用于预测蛋白质。在Nature Evolution and Ecology、Nature Communications、NAR、Bioinformatics等期刊发表学术论文多篇;研发了deepomics.org多组学数据分析系统,oviz.org数据可视化系统,FALCON蛋白质结构预测程序;培养了20多名计算生物学博士生和多名博士后。